性质提取器¶
工具包括如下：
bandgap, dbc, bader, cohp, dos, general, diff, converge
使用方法¶
建议使用如下方式. 所有的命令包括子命令可使用
'-h'查看帮助 。
例:
$ featurebox bandgap -h
$ fbx bandgap -h
$ featurebox bandgap -p /home/parent_dir
$ featurebox bandgap -f /home/parent_dir/paths.temp
使用 fbx -h ， fbx {sub_cmd} -h 获取更多信息。
传统python方式.
>>> from featurebox.cli.vasp_dos import DosxyzPathOut
>>> dosxyz = DosxyzPathOut(n_jobs=4, store_single=True)
>>> result = dosxyz.transfrom(paths_list)
>>> # More part: The following is not in command model.
>>> # final treatment to extractor need message and formatting.
>>> features = dosxyz.extractor(result,atoms=[0, 1, 2, 3], ori=["p-x","d-xy"],format_path=None)
注意¶
绝大多数子命令，如 ‘bader’ 包含输入方式。
单个案例:
如果使用 -p 方式，（默认方式，并且默认使用当前路径），即认为输入数据在此路径下，请保证此路径下，针对该问题，有必要的输入文件。
批处理:
如果使用 -f 方式，将读取文件（默认文件名 ‘paths.temp’）的所有路径。请确认此文件中含有路径信息。每行为一路径。
路径文件可以手动自定义，或者shell命令生成。这里我们建议使用 mgetool 模块中的 findpath 命令。其将随featurebox同步安装。现在可以一键使用 findpath 命令获取当前路径下的所有叶节点路径（建议切换到某路径下再操作，全盘搜索速度极慢）！！！
findpath 功能十分强大， 使用 findpath -h 获取更多介绍.
一些Extractor工具是需要第三方工具的。请下载并提前安装好。
性质 |
名称 |
dbc |
vaspkit <=1.2.1 |
cohp |
|
bader |
|
bader |
|
chg_diff |